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新闻资讯

蛋白质-RNA分子动力学

川沙总部

2015-07-21
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目前,由于人类基因图谱的靠近实现和日益丰硕的各类模式生物的全基因组的测定,人类已经进入了后基因组时期  。若是说基因是遗传信息的载体,蛋白质就是遗传信息和性命职能的具体实现者  。因而在这一大的布景下,蛋白质钻研日益凸显其沉要性  。“蛋白质钻研打算”作为基础科学领域的 四个沉大科学打算之一,已被正式列入“国度中持久科学与技术发展规划(2006-2020)”  。

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蛋白质若何急剧而正确地折叠到其职能结构是蛋白质科学领域的主题问题之一  。我们重要基于原子水平以及各类粗;降牡鞍字誓P,通过推算机仿照蛋白质折叠的动力学和热力学过程,并结合尝试进行钻研(左下图是arc蛋白质的三维骨架)  。最近的工作重要蕴含利用大规模并行推算来仿照含有硫键的蛋白质折叠以及金属离子辅助的蛋白质折叠,钻研downhill型折叠以及由此揭示出的半数叠问题的一些新的见解,分子伴侣援手下的蛋白质折叠等等  。 同时,我们还发展了蛋白质变构象活动和职能关系的钻研,神经退行性疾病有关蛋白的谬误折叠及荟萃机造钻研等  。

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RNA是性命活动中的沉要分子  。随着近年来对非编码RNA(ncRNA)的深刻钻研,人们发现ncRNA的职能拥有惊人的多样性  。 为了更好的意识其职能,必要钻研其形成特定的空间结构的机造  。JDB电子重要钻研兴致是发展各个档次的RNA模型,蕴含从简化的到全原子档次的模型,并用这些模型钻研RNA,尤其是pseudoknot(右下)结构的折叠机造  。Pseudoknot是一类极度沉要的RNA分子,拥有有趣的空间结构,并且多种沉要的相互作用参加了其折叠过程,决定了其不变性  。钻研pseudoknot结构能够使人们更深刻的意识各类物理化学成分在RNA折叠过程中所起到的作用,并有可能为开发新的结构预测软件提供新的思路  。

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